大白菜EST-SSR标记开发中非SSR标记的鉴别

大白菜EST-SSR标记开发中非SSR标记的鉴别

EST-SSR标记开

发过程中经常会遇到一些问题,例如引物重复设计等.本试验对从大白菜EST序列中开发的30个多态性SSR标记产生的多态性条带进行测序,结果发现有一些标记的多态性并不是由于其所含有的`简单重复序列重复次数的改变引起的,这类标记约占鉴定标记总数的13%.这些标记实际上属于EST-SCAR标记.在进行SSR变异对基因表达及功能影响方面的研究时,这类非SSR标记应该被排除.

作 者： 周新成 刘立峰 李化银 高建伟 作者单位： 山东省农业科学院蔬菜研究所,山东,济南,250100 刊 名： 山东农业科学 ISTIC 英文刊名： SHANDONG AGRICULTURAL SCIENCES 年，卷(期)： 2010""(4) 分类号： S634.1 Q503 关键词： EST-SSR 标记开发 多态性 测序 大白菜