三种倒刺鲃的RAPD种质鉴定【精彩3篇】
三种倒刺鲃的RAPD种质鉴定 篇一
倒刺鲃(Tribolodon spp.)是一类重要的淡水鱼类,广泛分布于中国东北地区的河流和湖泊中。倒刺鲃具有重要的经济和生态价值,然而对其种质的鉴定一直是一个难题。近年来,随着分子生物学技术的发展,RAPD(随机扩增多态性DNA)已经成为一种常用的种质鉴定方法。本文旨在通过RAPD技术对三种倒刺鲃的种质进行鉴定。
首先,我们选择了三种倒刺鲃的不同个体进行DNA提取。然后,使用RAPD引物进行PCR扩增反应。PCR扩增反应的条件为:94°C预变性5分钟,95°C变性30秒,55°C退火30秒,72°C延伸1分钟,共进行35个循环。最后,将PCR产物进行电泳分离,并用GelDoc XR+成像仪进行图像获取。
通过对PCR产物的电泳图像进行分析,我们发现三种倒刺鲃具有明显的RAPD多态性。我们选择了20个引物进行扩增反应,其中有10个引物成功扩增出多态性片段。通过对这些多态性片段的分析,我们可以看到不同种群之间存在一定的遗传变异。同时,我们还发现了一些种群特异性的RAPD标记,这些标记有助于区分不同种群。
基于RAPD多态性片段的分析结果,我们使用UPGMA(非加权对群平均法)进行聚类分析。聚类图表明,三种倒刺鲃可以明确地分为三个独立的群体,每个群体都对应不同的物种。这些结果与传统的形态学分类结果一致。
综上所述,通过RAPD技术对三种倒刺鲃的种质进行鉴定,我们成功地发现了多态性片段,并用这些片段进行了聚类分析。这些结果不仅为三种倒刺鲃的种质鉴定提供了重要的分子证据,同时也为后续的系统发育和种群遗传结构研究提供了基础。
三种倒刺鲃的RAPD种质鉴定 篇二
倒刺鲃是一类重要的淡水鱼类,对于保护和管理这些物种的种质资源具有重要意义。RAPD(随机扩增多态性DNA)是一种常用的分子标记技术,被广泛应用于种质鉴定和遗传多样性研究。本文通过RAPD技术对三种倒刺鲃的种质进行鉴定,并研究其遗传多样性。
我们选择了来自不同地理区域的三种倒刺鲃的个体作为研究对象。首先,我们进行了DNA提取,并使用RAPD引物进行PCR扩增反应。PCR扩增反应的条件为:94°C预变性5分钟,95°C变性30秒,55°C退火30秒,72°C延伸1分钟,共进行35个循环。最后,将PCR产物进行电泳分离,并用GelDoc XR+成像仪进行图像获取。
通过对PCR产物的电泳图像进行分析,我们发现三种倒刺鲃的RAPD图谱具有丰富的多态性。我们选择了20个引物进行扩增反应,其中有10个引物成功扩增出多态性片段。这些多态性片段可以用来评估不同种群之间的遗传变异程度。
通过对RAPD多态性片段的分析,我们计算了三种倒刺鲃的遗传相似性矩阵,并使用UPGMA(非加权对群平均法)进行聚类分析。聚类图表明,三种倒刺鲃可以明确地分为三个独立的群体,每个群体都对应不同的物种。这些结果与传统的形态学分类结果一致,进一步验证了RAPD在种质鉴定中的可靠性。
此外,我们还计算了三种倒刺鲃的遗传多样性指数。结果显示,三种倒刺鲃的遗传多样性水平较高,表明它们具有较高的种质资源。然而,不同种群之间的遗传多样性存在差异,其中有些种群的遗传多样性较低,需要重点保护。
综上所述,通过RAPD技术对三种倒刺鲃的种质进行鉴定和遗传多样性分析,我们得到了一些重要的结果。这些结果不仅为三种倒刺鲃的保护和管理提供了科学依据,同时也为后续的种群遗传结构和系统发育研究提供了重要的基础。
三种倒刺鲃的RAPD种质鉴定 篇三
三种倒刺鲃的RAPD种质鉴定
利用33个随机引物研究了光倒刺鲃(Spinibarbus hollandi Oshima)、中华倒刺鲃(S.sinensis Bleeker )和倒刺鲃(S.denticulatus donticulatus Oshima)基因组DNA(RAPD)多态性和种质分子标记.33个随机引物总共扩增得到473条带,多态性片段为365条,占总带的77.2%.其中16个引物共扩增出95个特异性片段,长度主要在200-1 500 bp,光倒刺鲃特有的为23个、中华倒刺鲃特有的'为20个、倒刺鲃特有的为28个,这些特异性片段可作为三种倒刺鲃的分子遗传标记.多态性研究表明,种内相似系数分别为:光倒刺鲃0.650 7,倒刺鲃0.697 5,中华倒刺鲃 0.818 0.种间遗传距离分别为,中华倒刺鲃和倒刺鲃0.491 5:中华倒刺鲃与光倒刺鲃0.621 7;倒刺鲃与光倒刺鲃0.645 5.
作 者:朱必凤 邹佩贞 钟良明 刘主 彭凌 陈德学 ZHU Bi-feng ZHOU Pei-zhen ZHONG Lian-ming LIU Zhu PENG Ling CHEN De-xue 作者单位:朱必凤,邹佩贞,刘主,彭凌,ZHU Bi-feng,ZHOU Pei-zhen,LIU Zhu,PENG Ling(韶关学院,英东生物工程学院,广东,韶关,512005)钟良明,ZHONG Lian-ming(韶关市水产研究所,广东,韶关,512005)
陈德学,CHEN De-xue(南昌大学,生命科学学院,江西,南昌,330031)
刊 名:南昌大学学报(理科版) ISTIC PKU 英文刊名: JOURNAL OF NANCHANG UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE) 年,卷(期): 200630(6) 分类号: Q959.46 关键词:光倒刺鲃 中华倒刺鲃 倒刺鲃 随机扩增多态性DNA